Lors du démarrage de la Nitendo DS, on arrive directement sur l'écran d'accueil du R4 (ce qui est d'ailleurs surprenant, car note console n'était pas paramétrée pour démarrer sur le Slot 1 directement).

L'interface est simple mais efficace, puisqu'elle dispose de trois menus : jeux, multimédia et Slot 2. Le premier sert évidemment à lancer ROMS et homebrews, le deuxième lance le lecteur multimédia Moonshell (pour lire les vidéos au format DPG, et les musiques), et le dernier sert à lancer des jeux GBA, si toutefois vous possédez une cartouche d'extension adéquate. Plusieurs thèmes sont disponibles pour le R4. Vous pourrez vous en rendre compte en consultant le site ndsthemes.com.



Une fois dans le menu jeu, le R4 se sert des deux écrans pour faciliter la navigation. Les répertoires, le nom des fichiers (au format NDS), ainsi que leur taille s'affichent sur l'écran du haut. La navigation entre ceux-ci se fait à l'aide de la croix multidirectionnelle de la console.

L'écran du bas, lui, sert à afficher quelques informations sur le fichier en surbrillance. Pour lancer un fichier sélectionné, il est nécessaire d'appuyer sur le bouton A, ou sur son icône à l'aide de l'écran tactile. Pour sa part, le bouton L sert à régler la luminosité de l'écran, au même titre que l'ampoule affichée dans le coin supérieur gauche de l'écran. L'autre gâchette modifie la couleur du bouton situé en haut à droite de l'écran tactile, qui sert à activer ou non le Soft-Reset (retour au menu sans éteindre la DS). Quant au bouton X, il sert à supprimer le contenu en surbrillance.




Le R4 possède un système de cheat code, qui est proposé lorsque l'on sélectionne un jeu pris en charge par le système. Une pression sur le bouton Y permet ainsi de paramétrer différentes fonctions concernant les cheat code. De nouveaux codes peuvent bien sûr être ajoutés.